Premierowego gola w najwyższej klasie rozgrywkowej strzelił natomiast 2 kwietnia 2006 w wygranej 2:1 konfrontacji z Jaguares, a mimo sporadycznych występów został ogłoszony przez lokalne media następcą jednego z ważniejszych graczy Pumas, Aíltona da Silvy.
Wiosną 2007, nie potrafiąc wywalczyć sobie miejsca w pierwszym składzie Pumas, Morales udał się na roczne wypożyczenie do ekipy Club Necaxa z siedzibą w Aguascalientes. Tam triumfował w rozgrywkach kwalifikacyjnych do Copa Libertadores – InterLidze, lecz również pełnił głównie rolę rezerwowego. Po powrocie do Pumas jego sytuacja uległa nieznacznej poprawie – jesienią 2008 jedyny raz był podstawowym piłkarzem drużyny, lecz już po upływie kilku miesięcy został ponownie relegowany do pozycji alternatywnego gracza. W tej roli w wiosennym sezonie Clausura 2009 zdobył swoje drugie mistrzostwo Meksyku i sukces ten powtórzył także dwa lata później, w sezonie Clausura 2011, lecz ani razu nie pojawił się na boisku, występując jedynie w drugoligowych rezerwach – Pumas Morelos.