Upamiętnienie Jego imieniem nazwano jedną z ulic na osiedlu Przylesie w Bydgoszczy-Fordonie Ulica Stanisława Brzęczkowskiego w Bydgoszczy w Targeo oraz osiedle mieszkaniowe w Koronowie Osiedle Mieszkaniowe im. Stanisława Brzęczkowskiego Koronowie KORONOWSKA SPÓŁDZIELNIA MIESZKANIOWA https://koronowskasm.pl/. Na budynku, w którym mieszkał przy ul. Gdańskiej 17 w Bydgoszczy znajduje się tablica pamięci. Głaz z tablicą pamiątkową znajduje się także w Koronowie przy ul. Pomianowskiego 4. Powstał on z inicjatywy Towarzystwa Miłośników Ziemi Koronowskiej we współpracy z Koronowską Spółdzielnią Mieszkaniową w latach 80. XX wieku.
W 1980 roku Towarzystwo Miłośników Ziemi Koronowskiej dla upamiętnienia 25. rocznicy śmierci artysty grafika i pedagoga urodzonego w Koronowie, ustanowiło medal honorowy jego imienia. To honorowe wyróżnienie jest przyznawane osobom oraz instytucjom szczególnie zasłużonym dla rozwoju kultury, edukacji i tożsamości Ziemi Koronowskiej. Oryginalny medal o średnicy ok. 80 mm przedstawia na awersie portret patrona, a na rewersie koronę z herbu miasta.