W latach 90. XX w. przez 2 lata był uczniem , a następnie od 1995–1999 był uczniem Szkoły Mistrzostwa Sportowego w Zakopanem.

1993/1994 W sezonie 1993/1994 zorganizowano pierwszą edycję Pucharu Kontynentalnego (wcześniej pod nazwą Pucharu Europy). Bojda zadebiutował w nim 9 marca 1994 na Wielkiej Krokwi w Zakopanem, gdzie oddał skok na 80,5 m i zakończył zawody na 53. miejscu. Następnego dnia na normalnej skoczni był 40. Kolejne dwa konkursy tego cyklu odbyły się w Szczyrbskim Jeziorze. W pierwszym zajął 38. miejsce, a w drugim zdobył pierwsze punkty, plasując się na ósmym miejscu. Oddał wówczas skok na 108,5 m. Była to najlepsza lokata Bojdy w całej jego dotychczasowej i późniejszej karierze, a zarazem jedyna w czołowej „dziesiątce”. W klasyfikacji generalnej zajął 156. miejsce z dorobkiem 32 pkt.

Na lutowych Mistrzostwach Polski 1994 w Zakopanem zdobył brązowy medal w zawodach drużynowychKS Wisła w składzie: Mariusz Wantulok, Aleksander Bojda, Adam Małysz. Indywidualnie był szesnasty na normalnej skoczni. W tym samym miesiącu w Wiśle uzyskał dwa tytuły mistrza Polski juniorów.