Edytor misji umożliwia stworzenie własnych scenariuszy gry.
Otwarta struktura plików pozwala na łatwe edytowanie i rozwijanie doktryn działania sztucznej inteligencji.
Akademia Marynarki Wojennej Stanów Zjednoczonych wykorzystywała grę do edukowania studentów w zakresie podejmowania decyzji na poziomie floty podczas swojego programu letnich seminariów.
Historia Studio Sonalysts Combat Simulations pracowało początkowo nad symulatorem krążownika rakietowego AEGIS. W związku z potrzebą symulacji całego teatru działań wojennych, zakres gry został rozszerzony.
Wydawca gry, Electronic Arts, współpracował wcześniej z wydawcą książek wojskowych i baz danych Jane’s Information Group. W wyniku tej współpracy Electronic Arts wydało serię symulatorów i gier strategicznych, sygnowanych marką Jane’s Combat Simulations. Sonalysts Combat Simulations stworzyło wydany wcześniej w tej serii symluator okrętu podwodnego Jane’s Combat Simulations: 688(I) Hunter/Killer.
26 października 2006 Strategy First wydało Fleet Command jako SCS-Fleet Command, bez odniesień do marki „Jane’s”. Gra została udostępniona w wersjach cyfrowych w serwisach GameTap i Steam.
Kolejne łatki rozszerzyły kompatybilność gry o systemy operacyjne Windows 2000 i XP.