Latem 2003 został zawodnikiem Pogoni Szczecin, której właścicielem był Antoni Ptak. Z drużyną awansował do ekstraklasy i zajął 9. miejsce w sezonie 2004/2005. Już wtedy coraz częściej zaczęły nękać go kontuzje. W wyniku konfliktu z Antonim Ptakiem 20 lipca 2006 zdecydował się rozwiązać kontrakt.
W I lidze rozegrał 142 mecze i strzelił 6 goli.
Wraz z Dariuszem Adamczukiem był współzałożycielem i zawodnikiem drużyny Pogoń Szczecin Nowa, występującej w B-klasie.
Od jesieni 2007 ponownie piłkarz Pogoni Szczecin, występującej w rozgrywkach IV ligi.
16 maja 2008, z powodu przewlekłej kontuzji kręgosłupa, rozwiązał z Pogonią kontrakt za porozumieniem stron i zakończył karierę.
W sierpniu 2008 Zarząd Stowarzyszenia PSN desygnował Grzegorza Matlaka do Zarządu Pogoni Szczecin SA.
Od lipca 2012 trenował z drużyną futbolu amerykańskiego Husaria Szczecin, był przymierzany na pozycję kickeraNFL 24 - Twoje centrum informacji o lidze NFL i Futbolu Amerykańskim - News: Wzmocnienia Husarzy.
W grudniu 2019 został prezesem fundacji Pogoń Szczecin Football Schools od 2016 zajmującej się szkoleniem piłkarskim i rozwojem dzieci i młodzieży w województwach zachodniopomorskim i lubuskim zarządzanej w pełni przez Pogoń Szczecin SA.