Enzym ten katalizuje reakcję przekształcania izocytrynianu do glioksalanu i bursztynianu, a reakcja ta jest odwracalna przy wysokich stężeniach bursztynianu i glioksalanu. W takim przypadku jabłczan powstawałby dzięki dużej produkcji glioksalanu w cyklu fotooddechowym pośrednio poprzez izocytrynian. Obserwacje związane z podawaniem inhibitora mitochondrialnej drogi cytochromowej – antymycyny a oraz inhibitora fosforyzacji oksydacyjnej – oligomycyny pokazują obniżenie się poziomu rybulozo-1,5-bisfosforanu (RuBP). Sugeruje to, że mitochondrialny transport elektronów jest ważny dla utrzymania odpowiedniego stężenia RuBP w chloroplastach i pozwala na sprawną aktywację enzymów chloroplastowych. Inhibitory mitochondrialne takie jak oligomycyna i antymycyna wydają się prowadzić do większego zredukowania fotosyntetycznego łańcucha transportu elektronów i mniejszego zakwaszenia lumen tylakoidów. Obserwowano także opóźnienie w aktywowaniu na świetle dehydrogenazy jabłczanowej zależnej od NADP pod wpływem oligomycyny lub rotenonu. Jedną z możliwych konsekwencji wysokiego stopnia zredukowania fotosystemu I jest wzrost natężenia reakcji Mehlera i podwyższenie produkcji H2O2 w chloroplastach. Stwierdzono również, że oligomycyna obniża poziom ATP w cytoplazmie protoplastów jęczmienia na świetle.