Efektem udanego wysiłku reformatorskiego stał się skokowy spadek zadłużenia Grupy i dużo wyższa produktywność.
Doświadczenie restrukturyzacyjne PKP dostarcza kilka istotnych wniosków dla rządów które decydują się na wysiłek polegający na restrukturyzacji przedsiębiorstw państwowych:
Problemy przedsiębiorstw państwowych mogą być tak utrwalone i głębokie że jedynym wyjściem jest przeprowadzenie szerokich, wielowymiarowych procesów restrukturyzacyjnych; Faktyczne funkcjonalne rozdzielenie odrębnych linii biznesowych i wsparcia biznesu jest warunkiem koniecznym lecz niewystarczającym do poprawy finansowej i operacyjnej efektywności przedsiębiorstwa Działania zmierzające do obniżenia nadmiernego zadłużenia w tym prywatyzacja i skupienie się na kluczowych aktywach sprzyja poprawie efektywności; Restrukturyzacja zatrudnienia, choć trudna z powodów społecznych jest niezbędna aby przedsiębiorstwa z przerostem zatrudnienia odzyskały sprawność finansową.
W latach 2016–2019 był prezesem funduszu inwestycyjnego Luma Holding działającego w branży przemysłowej.
Jakub Karnowski był członkiem wielu rad nadzorczych, m.in.
W latach 1999–2021 Agencji Rozwoju Przemysłu.
W latach 2012–2015 przewodniczący rady nadzorczej PKP Cargo i TK Telekom oraz członek rady nadzorczej PZU S.A.