Passacaglia na fortepian (2000) Praeludium II na skrzypce (2000) Uwertura na zespół perkusyjny (2001) Ballad Sakegura na fortepian (2002) Madrigal na chór mieszany i kwartet smyczkowy (2007) Cadenza I i II na flet solo (2009) Cadenza I i II na obój solo (2009) Cadenza I i II na klarnet solo (2009) Ku Muzom na chór żeński a cappella do słów Jana Kochanowskiego (2015) Rymy na chór żeński i orkiestrę do słów Jana Kochanowskiego (2017) 3 × 9 na dwa flety i organy (2018)
Dyskografia kompozytorska Maciej Żółtowski – Victimae Paschali Laudes, wykonawcy: Chór Akademii Teologii Katolickiej, Reanta Landowska-Szczerbaczewicz (sopran), Kazimierz Szymonik (dyrygent) – Chór Akademii Teologii Katolickiej – 1996 (DUX) Maciej Żółtowski – pieśni: Wiepers Dorf i Frühlingswinter, Intermezzo I – Frühlingswinter, Wiepersdorfer Gedichte und Lieder – 1998 (Falconia® Records, CD 29031998) Maciej Żółtowski – Beg-tse I – II Międzynarodowy Konkurs Współczesnej Muzyki Kameralnej im.