W 2000 powrócił do Czornomorca, w którym pracował na stanowisku asystenta trenera. We wrześniu 2001 objął stanowisko głównego trenera klubu i wywalczył z Czornomorcem awans do Wyższej Ligi. Ale początek sezonu w Wyższej Lidze był nieudanym, dlatego w październiku 2002 podał się do dymisjiОлександр Скрипник залишив посаду тренера «Чорноморця». Już wkrótce, w listopadzie 2002 zgodził się na propozycję Semena Altmana pomagać trenować Metałurh DonieckОлександр Скрипник буде допомагати Семену Альтману. Jednak po trzech miesiącach Altman i Skrypnyk opuściły Donieck i powróciły do Odessy, gdzie Altman poprowadził miejscowy Czornomoreć, a Skrypnyk został asystentem treneraАльтман очолив одеський «Чорноморець». W 2007 kierował ponownie drugą drużynę Czornomorca, który występował w Amatorskiej lidze. W listopadzie 2008 próbował razem z Altmanem ratować od spadku Łucz-Energię WładywostokСемен Альтман: Я не тренер на шість ігор. Od czerwca pomaga Altmanowi trenować Tawrię SymferopolUA-Футбол.