Medal im. Profesora Zygmunta Czubińskiego – wyróżnienie honorowe, przyznawanym za wybitne prace naukowe mające charakter regionalnych monografii geobotanicznych, których podstawą jest oryginalna koncepcja naukowa. Ustanowiono go w 2000 r. podczas Walnego Zebrania Członków Oddziału Poznańskiego Polskiego Towarzystwa Botanicznego. Jego pomysłodawcą był prof. Janusz Bogdan Faliński. Kapituła nadaje Medal raz na 3 lata. Po raz pierwszy wyróżnienia wręczono w 2001 roku na Ogólnopolskim Zjeździe PTB w Poznaniu. Wraz z medalem wręczany jest dyplom.
Członkostwo PTB nie jest warunkiem koniecznym do wyróżnienia Medalem.
Laureaci Medalu im. prof. Z. CzubińskiegoLaureaci Medalu im. prof. Z. Czubińskiego. 2001 zespół w składzie: prof. Władysław Matuszkiewicz, prof. Janusz B. Faliński, prof. Andrzej S. Kostrowicki, prof. Jan M. Matuszkiewicz, prof. Romuald Olaczek, prof. Teofil Wojterski za pracę pt. „Potencjalna roślinność naturalna Polski. Mapa przeglądowa 1:300 000” zespół w składzie: prof. Magdalena Ralska-Jasiewiczowa, prof. Tomasz Goslar, prof. Teresa Madeyska, prof. Leszek Starkel za pracę pt. „Lake Gościąż, Central Poland. A monographic study. Part 1" Instytut Dendrologii PAN w Kórniku za serię pt. „Atlas rozmieszczenia drzew i krzewów w Polsce” pod red. Stefana Białoboka, Zygmunta Czubińskiego i Kazimierza Browicza prof.