Produkcja horroru miała ruszyć pod koniec roku 2008, jednak została odroczona na marzec 2009. W październiku 2008 Aja ujawnił, że zdjęcia rozpoczną się wiosną. Oznajmił również, że „realizacja projektu jest utrudniona, nie tylko ze względu na jego rozbudowaną stronę techniczną i ryby wykonane przy użyciu CGI, lecz głównie dlatego, że większość akcji rozgrywa się w jeziorze”„Bootlegged Look at the 'Piranha 3D' Trailer!”. bloody-disgusting.com. 2010-01-09. [dostęp 2012-05-27]. „Całość ma miejsce w trakcie ferii wiosennych, więc studio chciało, by film wyszedł na lato, ale jeśli masz tysiąc statystów, którzy zostają zamordowani w jeziorze, musisz czekać na odpowiednią temperaturę wody, na pogodę, na wszystko” − dodał AjaUtichi, Joe (2008-10-10). „Exclusive: Alexandre Aja talks Mirrors and Piranha 3D”. rottentomatoes.com. [dostęp 2012-05-27]. Ekipa zaczęła kręcić film czerwcem 2009 roku w Bridgewater Channel, części zbiornika retencyjnego Lake Havasu w miejscowości Lake Havasu City. Woda akwenu została zabarwiona na krwistą czerwień„'Piranha 3D' Test Screened, Bloodiest Movie Ever?”. bloody-disgusting.com. 2009-11-26. [dostęp 2012-05-27].