W polityce zagranicznej bliższe relacje nawiązał z Libią, Algierią, Angolą, Kubą, Nikaraguą oraz Ghaną (z którą planował unię). Krytykował mocarstwa zachodnie, szczególnie francuską administrację François Mitterranda. Wydalał z kraju francuskich doradców i instruktorów.
Jeszcze w 1984 roku miał miejsce nieudany pucz przeciwko jego rządom. Prezydent zginął zastrzelony w trakcie wojskowego puczu w październiku 1987 roku. Autorem zamachu był Blaise Compaoré, który określił Sankarę mianem zdrajcy rewolucji. Compaoré, który objął władzę po morderstwie Sankary, zrezygnował z polityki nacjonalizacji oraz włączył kraj do Międzynarodowego Funduszu Walutowego i Banku Światowego. Nowy rząd stopniowo porzucił prawie wszystkie postulaty okresu SankaryMason, Katrina &, Knight, James (2011). Burkina Faso, 2nd. The Globe Pequot Press Inc. . s. 31.
Powiązane publikacje Thomas Sankara Speaks: The Burkina Faso Revolution, 1983–87, Thomas Sankara, Pathfinder Press, 1988, . We Are the Heirs of the World’s Revolutions: Speeches from the Burkina Faso Revolution 1983–87, Thomas Sankara, Pathfinder Press, 2007, . Women’s Liberation and the African Freedom Struggle, Thomas Sankara, Pathfinder Press, 1990, . Thomas Sankara e la rivoluzione interrotta,