Eazel Od lat 1999–2001 Stachowiak wnosił wkład w projekty programistyczne związane z Linuksem i był zatrudniony w Eazel jako jeden z czołowych programistów, wraz z Andym Hertzfeldem oraz Darinem Adlerem w celu utworzenia przeglądarki plików Nautilus. Był również twórcą Object Activation Framework (OAF) dla GNOME od 1999–2001. W 1999 roku został opiekunem interpretera Scheme dla Guile A Brief History of Guile, by Andy Wingo, Data dostępu: 2010-01-17.. Podczas pracy dla Eazel pracował również nad przeglądarką obrazów Eye of GNOME, GNOME Libs, Gravevine, GnoP oraz był programistą zajmującym się Medusa, Bonobo, GNOME VFS.
Był również członkiem zarządu GNOME Foundation Advogato: Personal info for mjs, Data dostępu: 2010-01-17.. W tym czasie Eazel został sprofilowany w Fortune, a Stachowiak został zapytany, dlaczego dołączył do Eazel.
Apple Po zamknięciu Eazel, większość starszych programistów (w tym Bob Tribble, Don Melton, Darin Adler, John Sullivan, Ken Kocienda i Stachowiak) oraz pracujący w Netscape nad Mozilla Firefox Dave Hyatt znaleźli w czerwcu 2001 roku zatrudnienie w Apple i zostali przyjęci w 2001 do zespołu odpowiedzialnego za przeglądarkę internetową Safari.