Jakub Henryk Zerneke (również Jakub Henryk Zenrecke, Jacob Heinrich Zenrecke, ur. 18 listopada 1672 w Toruniu, zm. 29 października 1741) – polski kronikarz, historyk, burmistrz Torunia.
Życiorys Był najmłodszym synem Johanna i Christine, córki rajcy toruńskiego Johanna Moellera (Möllera). Rodzina od strony ojca pochodziła z Bergen auf Rügen. Ród Zernecków od początku XVI wieku zajmował się kowalstwem i wytwórstwem broni. Na przestrzeni lat za sprawą rosnących dochodów i zawieranych małżeństw ród awansował do elity w Bergen. Pierwszym członkiem rodu, który osiadł w Toruniu, był Johann Zernecke. W 1636 roku przeprowadził się do Gdańska, dwa lata później osiadł w Toruniu, gdzie uczył się zawodu kupieckiego w Johanna Moellera. W 1653 roku ożenił się z Christiną. Para miała ośmioro dzieci, z czego jedno zmarło w dzieciństwie.
W okolicach 1676–1677 zmarła Christine Moeller. Osierocony Jakub Zerneke przez pójściem do szkoły był edukowany w domu przez Stephana Humiusa. W 1683 roku rozpoczął naukę w Gimnazjum Akademickim w Toruniu. Tam uczył się m.in. w historii u bogu Krzysztofa Hartknocha oraz języka polskiego. W 1692 roku rozpoczął naukę w gimnazjum w Gdańsku. Rok później odbył wyprawę po Prusach Wschodnich.