Początkowo był proboszczem polskokatolickiej parafii pw. Wniebowzięcia Najświętszej Maryi Panny w Gdyni. Jako proboszcz doprowadził do wybudowania nowego domu parafialnego z plebanią i wyremontowania świątyni. W latach 1987-1988 studiował na Wydziale Teologii Chrześcijańsko-katolickiej Uniwersytetu w Bernie, jednocześnie prowadząc w tym okresie badania archiwalne w Rzymie nad materiałami dotyczącymi Polskiego Narodowego Kościoła Katolickiego. Przez ponad dwadzieścia lat był proboszczem parafii pw. Matki Bożej Anielskiej w Kosarzewie, gdzie doprowadził do powstania kościoła, a także odrestaurował starą plebanię i wybudował budynek przeznaczony na nową plebanię.
Pod kierunkiem bpa prof. zw. dra hab. Wiktora Wysoczańskiego, rektora Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej, ks. Bajorek napisał rozprawę doktorską pt. ”Mariologia Biskupa Franciszka Hodura”, którą obronił 15 września 2005. Praca została wydana w 2007, przez Świdnicką Kurię Biskupią (). Jak podkreślał we wstępie do pracy prof. Stanisław Celestyn Napiórkowski:
Od 2010 jest proboszczem parafii św. Anny w Bielsku-Białej. 13 grudnia 2013 przeszedł na emeryturę w Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej w Warszawie i od tego czasu nie prowadzi zajęć dydaktycznych.
Przypisy