III patrol 2 stycznia USS „Guardfish” został skierowany w rejon Truk wyruszył na trzeci wojenny patrol. 12 stycznia storpedował i zatopił stary niszczyciel "Shimakaze" (750 BRT) o nazwie Patrolowiec Nr 1. 22 stycznia storpedował i zatopił statek o nieznanej nazwie o pojemności około (4000 BRT), a następnego dnia storpedował i zatopił atakujący go 1300-tonowy niszczyciel typu Minekaze . Po przemieszczeniu się w kierunku Rabaulu wykrył duży konwój, ale gwałtowne ataki eskorty po wykryciu okrętu podwodnego, uniemożliwiły mu podjęcie ataku. Skierował się do bazy i 15 lutego datarł do Brisbane w Australii.
IV patrol Na czwarty patrol wojenny USS „Guardfish” wypłynął 9 marca 1943 w rejon Archipelagu Bismarcka, Wysp Salomona i Nowej Gwinei. Pomimo poszukiwań nie natrafiono na jednostki japońskie i okręt bez nowych zatopień powrócił 30 kwietnia do bazy.
V patrol Na piąty patrol bojowy okręt wypłynął w ten sam rejon 2 maja. Po przekazaniu 18 maja dowodzenia USS „Guardfish” komandorowi podporucznikowi Norvellowi Gardnerowi Wardowi 13 czerwca storpedowano i zatopiono frachtowiec "Suzuya Maru" (901 BRT), a drugi trafiono, ale z powodu szybkiej kontrakcji sił eskorty nie ustalono dalszego losu jednostki.