Po zmyleniu pościgu powrócił 31 lipca do bazy na Midway.
IX patrol Na dziewiąty patrol bojowy wyruszył z Guam 23 sierpnia w stadzie z USS Tresherem i USS Sunfishem. 20 września podczas 40-minutowego ostrzału z działa pokładowego zatopił japoński sampan na południe od wyspy Chichi-jima. 25 września USS „Guardfish” storpedował i zatopił frachtowiec "Miyakawa Maru" (873 BRT). 24 października powrócił do Pearl Harbor.
X patrol Po objęciu dowództwa 27 października przez komandora porucznika Douglasa Thompsona Hammonda USS „Guardfish” 26 listopada 1944 wyruszył na swój dziesiąty patrol bojowy na Morze Południowochińskie. Do 24 stycznia nie napotkano japońskich jednostek, kiedy to po obserwacjach w nocy przez peryskop rozpoznano napotkaną jednostkę jako japoński okręt podwodny. Z wystrzelonych czterech torped jedna trafiła i zatopiła jak się okazało amerykański okręt ratunkowy Extractor (ARS - 15) (1615 BRT). W czasie ataku zginęło sześciu amerykańskich marynarzy, 73 uratował USS „Guardfish”, z którymi wrócił na Guam 26 stycznia 1945.
XI patrol 27 lutego 1945 wypływając z Saipanu rozpoczął swój jedenasty patrol bojowy.