Życie prywatne Buffer obecnie mieszka w Południowej Kalifornii. Buffer jest trzykrotnie żonaty. Po raz pierwszy ożenił się w wieku 21 lat, w 1965 roku. Z tego małżeństwa, które zakończyło się rozwodem w 1972 roku, ma dwóch synów: Michaela i Matthew. Ponownie się ożenił w 1999 roku. To małżeństwo również zakończyło się rozwodem w 2003 roku. Obecnie jest żonaty z Christine.
Jest przyrodnim bratem Bruce’a Buffera, konferansjera specjalizującym w MMA federacji UFC, który strzeże również interesów prawnych Michaela. Michael i Bruce są wnukami byłego mistrza świata w wadze koguciej Johnny’ego Buffa.
W 1989 roku po 45 latach skontaktował się ze swoim biologicznym ojcem, Josephem Bufferem, który zobaczył go w telewizji. Wkrótce zapoznał syna ze swoim przyrodnim bratem (synem z drugiego małżeństwa) Bruce’em.
W lutym 2008 roku wykryto u niego raka krtani, ale przeszedł udaną operację wycięcia nowotworu i już w kwietniu pojawił się w ringu, aby zapowiedzieć walkę Joego Calzaghe’ego z Bernardem HopkinsemMichael Buffer – Najsłynniejszy konferansjer..