W 1962 roku zmienił nazwę na Dnipro. Klub brał udział w rozrywkach piłkarskich byłego ZSRR z większymi sukcesami, które przyszły w latach 80. XX wieku. Wtedy to 2 razy zdobyto Mistrzostwo ZSRR oraz Puchar ZSRR i Superpuchar ZSRR.
Od początku rozrywek w niezależnej Ukrainie klub występował w Wyższej Lidze. W sezonie 2016/17 klubowi odjęto 12 punktów za długi z byłymi pracownikami, na koniec tego sezonu spadł do Pierwszej ligi. Ostatecznie klub trafił do Drugiej ligi.
Po zakończeniu sezonu 2017/18 w którym zajął końcowe 8. miejsce w grupie B, mając -18 pkt na starcie, został ukarany przez Komisję Dyscyplinarną FIFAДисциплінарний комітет ФІФА ухвалив рішення про зниження в класі ФК Дніпро - UA-Футбол i pozbawiony statusu klubu profesjonalnegoП'ять клубів ПФЛ втратили професійний статус - UA-Футбол. Klub ogłosił o kontynuacji występów na poziomie amatorskimФК Дніпро може подати заявку на участь в аматорському чемпіонаті - UA-Футбол. W lipcu 2019 klub nie przystąpił do żadnych rozgrywek i został rozwiązanyЗдається, це кінець. Дніпро не заявився на аматорський чемпіонат наступного сезону - UA-Футбол.