Struktura Wydział składa się z następujących jednostek: Katedra Analizy Matematycznej, Matematyki Obliczeniowej i Metod Probabilistycznych (kierownik dr hab. Sergiusz Kużel, prof. AGH) Zespół Analizy Matematycznej Zespół Matematyki Obliczeniowej i Analizy Dużych Zbiorów Danych Zespół Metod Probabilistycznych Katedra Matematyki Dyskretnej (kierownik prof. dr hab. Mariusz Woźniak) Katedra Matematyki Finansowej (kierownik dr hab. Anna Dudek, prof. AGH) Katedra Równań Różniczkowych (kierownik dr hab. Krzysztof Ciepliński, prof. AGH)
Kierunki i specjalności Obecnie wydział kształci studentów na studiach licencjackich i magisterskich na kierunku matematyka. Na II stopniu studiów w roku akademickim 2024/2024 były dostępne następujące specjalności: matematyka finansowa, matematyka w informatyce, matematyka w naukach technicznych i przyrodniczych, matematyka obliczeniowa i komputerowa, matematyka ubezpieczeniowa i statystyczna analiza danych, matematyka w zarządzaniu. Ponadto nauczyciele akademiccy WMS prowadzą zajęcia z matematyki na wszystkich wydziałach i w szkole międzywydziałowej AGH z wyjątkiem Wydziału Zarządzania.