Jonathan Caouette (ur. 26 listopada 1973 w Houston w Teksasie) – amerykański aktor, reżyser, scenarzysta i montażysta filmowy, związany z kinem awangardowym.
Życiorys Urodził się w dysfunkcyjnej rodzinie – ojciec porzucił ją jeszcze kiedy Jonathan był dzieckiem, a matka (na skutek terapii elektrowstrząsowej, której została poddana w młodości) chorowała na schizofrenię. Caouette został jej odebrany jako kilkulatek i przez jakiś czas tułał się po domach dziecka i rodzinach zastępczych, by w końcu trafić pod opiekę swoich surowych i apodyktycznych dziadków. U nich, wiecznie nieobecnego dziadka i podobnie jak matka, cierpiącej na problemy psychiczne babci, spędził swoją młodość. Jako nastolatek odkrył w sobie skłonności homoseksualne, co zaowocowało pierwszym związkiem w wieku 15 lat z kolegą ze szkoły. Mimo to doczekał się jednak syna, Josha.
Jako 11-latek odkrył to, co stało się później największą pasją jego życia – kino. Na pożyczonej od sąsiada kamerze 8 mm kręcił swoje pierwsze, amatorskie filmy (później ich fragmenty wykorzystał w swoim najsłynniejszym dziele, "Tarnation"). Od 1987 do 1990 uczęszczał do Westbury High School w Houston w Teksasie.