W 1874 roku następują przenosiny do innego budynku, gdzie muzeum ma do swojej dyspozycji całe piętro. Po sukcesie wspomnianej wystawy, w 1887 roku, muzeum zyskuje własny budynek (pochodzący z XVIII wieku) w okolicy jednego z zakładów górniczych. Nowe otwarcie nastąpiło 27 grudnia 1888 roku (Starego Stylu), a kolekcja liczyła już ponad 16 tysięcy eksponatów. Szybko stało się ono jedną z największych atrakcji Jekaterynburga na przełomie XIX i XX wieku. Według danych z 1901 roku największym działem był zoologiczny, liczący ponad 3 tysiące obiektów. Cenne eksponaty (łącznie 788 obiektów w 1901 roku) posiadał też dział paleontologiczny, w tym szkielet prehistorycznego jelenia i czaszkę mamuta. Na początku XX wieku otwarto kolejne działy: archeologiczny, historyczny oraz galerię obrazów. Muzeum zaczęło także gromadzić wielką kolekcję numizmatyczną.
thumb|250px|right|Fridtjof Nansen w muzeum, 1913 rok thumb|250px|right|Dzwon pochodzący z XVIII wieku, jeden z eksponatów W 1917 roku muzeum posiadało 28 tysięcy eksponatów, podzielonych na 17 działów. Zmiany dla muzeum nadeszły wraz z przewrotem bolszewickim w 1917 roku i rosyjską wojną domową.