Łącznie w reprezentacji Włoch w latach 1997–2007 rozegrał 57 meczów, w których zdobył 25 goli.
Kariera trenerska lewo|mały|Filippo Inzaghi jako trener AC Milanu, 2014 rok. Filippo Inzaghi po zakończeniu kariery piłkarskiej rozpoczął karierę trenerską. Prowadził AC Milan U-17 (2012–2013) i AC Milan U-19 (2013–2014 – Torneo di Viareggio 2014)Pippo Inzaghi Retires, Takes Coaching Job At AC Milan [data dostępu: 2012-07-24] . 1 lipca 2014 roku po zwolnieniu Clarence'a Seedorfa został trenerem profesjonalnej drużyny AC Milanu, z której po sezonie 2014/2015 odszedł po zajęciu 10. miejsca w Serie A.