Specyficzna budowa kądziołków przędnych świadczy prawdopodobnie o jego najbliższym pokrewieństwie z rodzinami z grupy Dysderoidea: komórczakowatymi (Dysderidae), Oonopidae, Orsolobidae i Segestriidae. Trogloraptor nie ma jednak synapomorfii łączących te rodziny, co sugeruje, że jest taksonem siostrzanym dla kladu łączącego te cztery grupy. Trogloraptor marchingtoni jest znany jedynie z jaskiń w południowym Oregonie. Jeśli Trogloraptor to faktycznie bazalny przedstawiciel Dysderoidea, oznaczałoby to, że jest kolejnym reliktem występującym na terenie łańcucha Klamath-Siskiyou, po m.in. sekwoi wieczniezielonej, sewelu i Ascaphus truei.
Trogloraptor marchingtoni jest jedynym opisanym przedstawicielem rodziny Trogloraptoridae; Griswold i in. nie wykluczają jednak, że młodociany pająk zebrany w podszycie starego lasu w Klamath-Siskiyou na terenie północnej Kalifornii należy do drugiego gatunku.
Biologia i ekologia Okazy Trogloraptor marchingtoni zebrano z ciemnej strefy jaskini, gdy wisiały na niciach przyczepionych do dachu jaskini. Nie zaobserwowano polowania ani zachowań godowych.