Wieczorem jednak uciekł w towarzystwie daimyō Aizu i Kuwany, aby na pokładzie statku „Kaiyō Maru” udać się do Edo.
thumb|Yoshinobu Tokugawa ucieka do Edo – w tle pożar zamku Osaka „Kaiyō Maru” nie przypłynął jednak, co zmusiło sioguna do spędzenia nocy na amerykańskim okręcie USS „Iroquois”, zakotwiczonym w zatoce. Spóźniona jednostka przybyła następnego dnia.
Zorientowawszy się, że siogun porzucił dowodzenie, resztka wiernych mu do tej pory wojsk opuściła zamek i poddała się wojskom cesarskim. Tokugawa tłumaczył później, iż był zaniepokojony cesarskim poparciem dla działań Satsumy i Chōshū; dodał również, że na widok cesarskiego proporca ustała w nim wszelka chęć do walki.
Francuscy doradcy wojskowi, Jules Brunet i André Cazeneuve, obecni podczas bitwy, opuścili Osakę i powrócili do Edo 14 stycznia wraz z Takeakim Enomoto na pokładzie „Fujisana”. Enomoto przywiózł ze sobą dokumenty oraz skarb w postaci 180 000 ryō.
Konsekwencje right|thumb|Mury zamku Osaka w 1865 roku