Tomáš Kóňa (ur. 1 marca 1984 w Nitrze) – słowacki piłkarz grający na pozycji środkowego pomocnika. Od 2017 roku jest zawodnikiem klubu FC Nitra.
Kariera klubowa Swoją karierę piłkarską Kóňa rozpoczął w klubie FC Nitra. W sezonie 2003/2004 awansował do pierwszej drużyny Nitry i wtedy też zadebiutował w niej w drugiej lidze słowackiej. W sezonie 2004/2005 wywalczył z Nitrą awans z drugiej do pierwszej ligi słowackiej.
Na początku 2006 roku Kóňa został zawodnikiem Sparty Praga. W sezonie 2006/2007 wywalczył ze Spartą mistrzostwo Czech oraz zdobył Puchar Czech. W sezonie 2007/2008 grał w rezerwach Sparty.
Przed sezonem 2008/2009 Kóňa został wypożyczony ze Sparty do FC Zlín. Rundę wiosenną tamtego sezonu spędził natomiast na wypożyczeniu w Artmedii Petržalka. W sezonie 2009/2010 grał na wypożyczeniu w FC Nitra.
W 2010 roku Kóňa przeszedł na wypożyczenie do FK Senica. W klubie tym zadebiutował 17 lipca 2010 w przegranym 0:3 wyjazdowym meczu ze Spartakiem Trnawa. W sezonach 2010/2011 i 2012/2013 wywalczył z Senicą dwa wicemistrzostwa Słowacji.
Latem 2015 roku Kóňa został zawodnikiem Spartaka Myjava. Swój debiut w nim zaliczył 19 lipca 2015 w wygranym 4:2 domowym meczu ze Spartakiem Trnawa. W Myjavie grał do końca 2016 roku.