Nurek notuje liczbę zaobserwowanych okazów danego gatunku na losowo wybranych poletkach – wewnątrz ramki o powierzchni 0,1 m² (dziesięciokrotnie w każdej strefie), oznacza wskaźnik pH i przewodność elektryczną wody, pobiera próbki osadów i wody do analiz laboratoryjnych (1,5 dm³ z transektu) oraz wykonuje zdjęcia powierzchni wody (obszar 5×5 m) i fitosocjologiczne zdjęcia szuwarów (na każdym płacie roślinności).
Przykłady zastosowań metod transektowych Transektowe badania ornitologiczne 240px|thumb|Prawdopodobieństwo zauważenia motyli w transekcie pasmowym jest zależne od liczebności populacji w siedlisku 240px|thumb|Strefa przejściowa (ekoton) między zbiorowiskami leśnymi i nieleśnymi w Puszczy Białowieskiej Ornitologiczne oszacowania zmian liczebności ptaków mogą być wykonywane w leśnych transektach liniowych o szerokości ok. 100 m (ok. 50 m z obu stron trasy). W terenie otwartym obserwuje się pasy o szerokości ok. 200 m. Pomiar obejmuje 5 liczeń zauważonych okazów.