Od tej pory w centrali funkcjonowało Biuro „C” MSW, a w województwach wydziały „C” KW MO.

Kilka lat później doszło do połączenia jednostek w jedną strukturę. Na mocy zarządzenia organizacyjnego nr 098 ministra z 1 października 1965 r. Centralne Archiwum MSW zostało rozwiązane, a jego zadania przejęło Biuro „C” MSW. W konsekwencji wobec zintegrowanego pionu używano wymiennie obu nazw: w oficjalnej korespondencji komórka występowała jako Centralne Archiwum MSW (w terenie archiwa KW MO), natomiast na użytek wewnętrzny stosowano określenie Biuro „C” MSW (oraz wydziały „C” KW MO).

Kolejne lata były okresem rozwoju organizacyjnego biura, które stało się jedną z najbardziej rozbudowanych komórek w systemie organów bezpieczeństwa. Jednostka prowadziła ewidencję czynnej i wyeliminowanej sieci agenturalno-operacyjnej zarówno na rzecz SB i MO, jak również na potrzeby WSW, Zarządu II SG i Zwiadu WOP. W ostatniej dekadzie PRL Biuro „C” MSW przejęło większość spraw związanych z informatyzacją (z wyjątkiem obsługi Rządowego Centrum Informatycznego PESEL), gdy na mocy zarządzenia nr 016 ministra z 31 marca 1980 r. w składzie pionu znalazły się struktury rozwiązanego Biura Informatyki MSW (jako wydziały IX–XI).