Czas nauki trwał dziesięć lat, podczas których studenci zdobywali niezbędną wiedzę rabiniczną do uzyskania święceń na rabina. Edukacja świecka umożliwiała im spełnienie państwowych wymogów na rządowego rabina. W ten sposób realizowano zamiar rządu rosyjskiego, który chciał by w Rosji służyli rosyjskojęzyczni rabini. Pojawiła się jednak silna opozycja w kręgach żydowskich, która zmusiła w 1886 roku Reinesa do zamknięcia jesziwy. Kolejne próby jej przywrócenia nie powiodły się. Mniej więcej w tym samym czasie, społeczność żydowska z Manchesteru w Anglii zaprosiła Reinesa do siebie. Przebywał tam przez trzy miesiące, wymieniając się swoją wiedzą i doświadczeniem. Uznał jednak, że Anglia nie jest właściwym dla niego miejscem do nauczania i powrócił do Rosji. Zamieszkał w Lidzie, gdzie w 1905 roku ponownie założył szkołę religijną Tora Vodaas. Reines odegrał także ważną rolę w utworzeniu instytucji kolel, która umożliwiała żonatym mężczyznom kontynuowanie studiów talmudycznych po zakończeniu edukacji w jesziwie.
W dniu 7 marca 1891 roku zmarł jego syn Mojżesz (ur. 1870 w Lidzie), który również był rabinem.