Prezbiterium także jest wykonane na planie półkola. W obu przednich narożnikach łączących prezbiterium i ściany boczne znajdują się rzeźby Świętego Piotra. Tuż poniżej nich, jeszcze w krańcach prezbiterium znajdują się proste wyświetlacze elektroniczne, ze względu na umieszczenie filarów w kościele, takie wyświetlacze są dwa, aby teksty piosenek, psalmów (a czasami modlitw) były widoczne z każdej części kościoła. Dawniej zamiast tych wyświetlaczy po lewej stronie kościoła znajdował się biały ekran na którym tekst wyświetlał rzutnik umieszczony na jednym z filarów. Po prawej stronie od prezbiterium znajduje się oszklone (witraże) wejście do kaplicy, w której znajdują się stara ambona i stary ołtarz. Nad wejściem do kaplicy umieszczona jest w ceglanym łuku na tle "złotej" mozaiki replika madonny jasnogórskiej. Na prawo od niej znajduje się podświetlany witraż przedstawiający wizerunek świętego męczennika. Po lewej stronie od prezbiterium na poziomie wejścia do kaplicy znajduje się replika obrazu "Jezu, Ufam Tobie". Poniżej obrazu wmurowane są relikwie św. Maksymiliana.