Kierunki studiów UAC składa się z 10 wydziałów (jednostki organizacyjne dydaktyczno-badawcze), działających w dziedzinach: biologii – Departamento de Biologia nauk rolniczych – Departamento de Ciências Agrárias edukacji – Departamento de Ciências da Educação nauki, technologii i rozwoju – Departamento de Ciências Tecnológicas e Desenvolvimento ekonomii i zarządzania – Departamento de Economia e Gestão nauk o Ziemi – Departamento de Geociências historii, filozofii i nauk społecznych – Departamento de História, Filosofia e Ciências Sociais lingwistyki i literatury współczesnej – Departamento de Línguas e Literaturas Modernas matematyki – Departamento de Matemática oceanografii i rybołówstwa – Departamento de Oceanografia e Pescas oraz dwóch związanych szkół pielęgniarstwa (Escola Superior de Enfermagem) w Angra do Heroísmo i Ponta Delgada, z którymi wspólnie prowadzi badania naukowe i interdyscyplinarne kursy.
Uniwersytet utrzymuje również współpracę międzynarodową;