Do podstawowej problematyki badań Zakładu należy: Problematyka rozwoju rzeźby (pod wpływem zdarzeń ekstremalnych) Transformacja stoków w Beskidach Zachodnich Skutki działania powodzi opadowych Transformacja wybranych karpackich dolin rzecznych Zmiany środowiska Karpat polskich wskutek wysiedlenia ludności po II wojnie światowej Paleogeografia Wyżyny Woźnicko–Wieluńskiej Zjawiska krasowe na Wyżynie Częstochowskiej
Problematyka badawcza Zakładu Geografii Fizycznej obejmuje także zagadnienia geografii gleb oraz biogeografii
Samodzielni pracownicy naukowi: dr hab. Józef Kukulak – kierownik Zakładu prof. dr hab. Roman Soja dr hab. Tomasz Bryndal dr hab. Joanna Zawiejska
Zakład Geoinformacji i Badań Geośrodowiskowych Samodzielni pracownicy naukowi: prof. dr hab. Adam Łajczak – kierownik Zakładu dr hab. Jacek Szmańda
Zakład Geografii Społeczno-Ekonomicznej Zakład powstał w miejsce Katedry Geografii Gospodarczej, która istniała od 1954 roku. Kierownikiem katedry była prof. dr Maria Dobrowolska. W roku 1972, czyli tuż po powstaniu Instytutu Geografii na miejsce katedry powołano Zakład Geografii Ekonomicznej, którego kierownikiem został prof. dr hab. Lech Pakuła. Od 2009 roku jest to Zakład Geografii Społeczno-Ekonomicznej, którego kierownikiem jest prof. dr hab.