Badanie naukowe Prace naukowe, obejmujące różne specjalistyczne dyscypliny oraz obszary interdyscyplinarne, są prowadzone m.in. w instytutach stowarzyszonych z UR, np.: Leibniz-Institut für Atmosphärenphysik e.V. (IAP) (fizyka atmosfery), Institut für Anwaltsrecht und anwaltsorientierte Juristenausbildung (zawody prawnicze), Institut für Bankrecht und Bankwirtschaft e.V. (bankowość, finanse, zarządzanie), Leibniz-Institut für Katalyse e.V. (LIKAT; instytut katalizy), Leibniz-Institut für Ostseeforschung Warnemünde (IOW; problemy Bałtyku), Ostseeinstitut für Marketing, Verkehr und Tourismus (OIR; region bałtycki; marketing, transport, turystyka), Institut für Ökotechnologie (ekotechnologia), Hanseatic Institute for Entrepreneurship and Regional Development (HIE-RO) (HIE-RO; przedsiębiorczość i rozwój regionalny).
Współpraca międzynarodowa UR ściśle współpracuje z 50 uczelniami partnerskimi na całym świecie. W ramach programu ERASMUS współdziała z niemal 200 partnerami w Europie.
Rektorzy, profesorowie i absolwenci Wyrazem szacunku UR dla swojej historii jest gromadzenie zbiorów informacji o ludziach związanych z uczelnią, m.in. opracowywanie: Catalogus Professorum Rostochiensium (CPR), w którym obecnie znajduje się ok.