W sezonie 1991 klub debiutował w najwyższej lidze radzieckiej zajmując 13.pozycję.
Liga ukraińska (1992–2015) Od początku rozrywek w niezależnej Ukrainie klub występował w Wyższej Lidze. Sezon 2011/12 spędził w Pierwszej Lidze, ale szybko wrócił do Premier-lihi.
W czerwcu 2012 właścicielem klubu został Ołeksandr Bohusłajew, który kupił klub od Ihora DworeckiegoUA-Футбол. Запорожский „Металлург” купил Богуслаев.
W sezonie 2015/2016 klub miał problemy finansowe. W grudniu 2015 zawodowi gracze i trener opuścili klub, a skład Metałurha zasilili piłkarze z drużyny młodzieżowej. W 2016 roku zespół nie zagrał żadnego meczu, 14 marca 2016 został zdyskwalifikowany z rozgrywek Premier-ligiМеталург виключений зі змагань під егідою УПЛ - UA-Футбол, a następnie ogłosił bankructwo i został rozwiązany.
Metałurh założony z FK Rosso Nero (2016–2018) 26 marca 2016 w Zaporożu odbyło się spotkanie organizacji publicznej „Metałurh na wieki”, na którym podjęto decyzję o zmianę nazwy amatorskiego klubu „Rosso Nero”, założonego w 2009 przez przedsiębiorcę Andrija Bohatczenka, na Metałurh Zaporoże. Na tym samym posiedzeniu, grupa przejęła symbole klubu i kolory MetałurhaР.Акбаш: Новий Металург стартує в аматорському чемпіонаті.