W rezultacie, we wrześniu 1991 Maada Bio powrócił do kraju i wszedł w skład grupy liczącej 600 żołnierzy, walczącej w dystrykcie Kailahun z siłami RUF.
Zamach stanu i rządy wojskowe 29 kwietnia 1992 Maada Bio, razem z kilkoma towarzyszami z armii, odegrał wiodącą rolę w dokonaniu zamachu stanu. Grupa wojskowych opanowała tego dnia Freetown i zmusiła prezydenta Momoha do ucieczki do Gwinei. Wojskowi zarzucali jego administracji nieradzenie sobie z rebelią RUF, złe zarządzanie krajem i korupcję. Władzę przejęła junta wojskowa, która utworzyła Tymczasową Narodową Radę Rządzącą (NPRC) na czele z Valentinem Strasserem jako szefem państwa. Maada Bio objął w niej stanowisko ministra informacji i transmisji. 5 lipca 1994 został wiceprzewodniczącym NPRC. W tym samym roku awansował do stopnia generała brygady.