Hamulec w lokomotywach seryjnych był dźwigniowy, z klockami żeliwnymi przytykanymi od przodu do kół obu osi.
Modernizacje thumb|Zmodernizowana WLs50M3 w Rudach thumb|Zmodyfikowana WLs50 z łańcuchowym przeniesieniem napędu na Wigierskiej Kolei Wąskotorowej Podczas długiej produkcji wprowadzano drobne zmiany i ulepszenia, jednak konstrukcja nie doczekała się istotniejszej modernizacji fabrycznej oprócz zmiany silnika. Indywidualne lokomotywy były modyfikowane w różny sposób przez użytkowników. Czasem polepszano warunki obsługi, np. instalując ogrzewanie nawiewne kabiny. Lokomotywy na kolejkach turystycznych bywały też modyfikowane wizualnie w celu nawiązania wyglądem do parowozów (np. na kolejce parkowej w Bydgoszczy).
W 1990 roku wykonujący naprawy tych lokomotyw Zakład Naprawy Taboru Samochodowego i Sprzętu w Brzesku wdrożył seryjną modernizację lokomotyw Wls40/50, w kilka odmianach. Odróżniają się one z zewnątrz wymianą całości oblachowania na nowe, kanciaste, z zamkniętą ogrzewaną budką maszynisty i dwoma wpuszczonymi w blachy nadwozia reflektorami dla każdego kierunku jazdy, z czerwonymi sygnałami końca pociągu.