W glebie mogą przetrwać nawet 20 lat i dłużej.
Zwalczanie Zalecane jest wykrywanie choroby w okresie zbiorów, możliwe jest także podczas przechowywania bulw.
Rak ziemniaka obniża plony tego warzywa, ponieważ powoduje gnicie bulw, które przez to nie nadają się do spożycia. Wywołujący chorobę grzyb może przetrwać w glebie kilkadziesiąt lat od zaprzestania uprawy ziemniaków. Jednocześnie nie istnieją skuteczne metody agrotechniczne ani chemiczne zwalczania raka ziemniaka. Jedynym sposobem ochrony upraw jest stosowanie odmian ziemniaka odpornych na chorobę, jednakże S. endobioticum ma zdolność wytwarzania nowych odmian, które są w stanie atakować nowe odmiany ziemniaka.
Ze względu na swój charakter S. endobioticum objęty jest obowiązkiem zwalczania, co w Polsce reguluje Rozporządzenie Ministra Rolnictwa i Rozwoju wsi z dnia 5 sierpnia 2004 r. w sprawie szczegółowych sposobów postępowania przy zwalczaniu i zapobieganiu rozprzestrzeniania się grzyba Synchytrium endobioticum. Obrót i uprawa ziemniaków jest objęta kontrolą Państwowej Inspekcji Ochrony Roślin i Nasiennictwa, która bada pola uprawne pod kątem obecności patogenu.