Próby wytrzymałościowe prowadzono na nim od czerwca 2012 roku w należącym do Aviation Industry Corporation of China ośrodku w Xi’an. 23 grudnia 2016 roku (16 grudnia) po raz pierwszy w powietrze wzbił się drugi latający prototyp FC-31, bo takie oznaczenie eksportowe otrzymał samolot, o numerze 31003. Według chińskich źródeł maszyna jest w pełni porównywalna do amerykańskich rozwiązań zastosowanych w samolotach F-35. Na drugim, latającym prototypie zainstalowano elementy wyposażenia i awioniki mające znaleźć się w docelowej, seryjnej wersji. Były to między innymi radiolokator Typ 1475 z anteną typu AESA oraz układem rozproszonych czujników optoelektronicznych. Seryjne samoloty mają być wyposażone w znajdujący się przed kabiną pilota optoelektroniczny system poszukiwania i śledzenia celów powietrznych w podczerwieni EORD-31. Ma być on, według słów producenta, przy zasięgu 185 km, zdolny do wykrycia samolotu F-22A z odległości 110 km a bombowca Northrop B-2 Spirit z odległości 150 km. Program badań i rozwoju J-31 finansowany jest ze źródeł własnych producenta i współpracujących z nim instytucji i przedsiębiorstw co niestety przekłada się na nie najszybsze tempo całości prac. W dalszej przyszłości realizowana będzie wersja myśliwsko-bombowa samolotu oznaczona jako FBC-31. Próby zakładowe samolotu powinny zakończyć się w 2019 roku.