Parafia św. Klemensa Papieża w Skalniku – parafia rzymskokatolicka z siedzibą w Skalniku, znajdująca się w dekanacie Nowy Żmigród w diecezji rzeszowskiej. Erygowana w 1480 roku.
Historia Skalnik jest jedną z najstarszych parafii na terenie południowej Polski. Swymi początkami sięga IX wieku. Wieś leżała w państwie Wiślan. Od Skalnika do dzisiejszej granicy ze Słowacją jest zaledwie kilkanaście kilometrów. W takim położeniu należy też przyjąć, że do parafii docierały echa działalności świętych Cyryla i Metodego, którzy w 863 roku przybyli na Morawy.
Istnieje przypuszczenie, że Modrzewiowa Góra, jak nazywano wzgórze, na którym stoi kościół, była we wczesnym średniowieczu miejscem kultu pogańskiego. Przyjmuje się, że początkach dziesiątego stulecia w tym miejscu stanął drewniany kościół pod wezwaniem św. Klemensa. Wokół kościoła, a właściwie wokół kopca kościelnego, rósł wieniec dębów. Do dzisiejszego dnia zachował się tylko jeden z nich. Powstanie ośrodka religijnego i wybudowanie tam kościoła wieś zawdzięcza św. Metodemu. Cyryl i Metody przywieźli relikwię św. Klemensa z Chersonezu. Jeszcze w połowie XX w. starzy ludzie podawali, że "dawniej" odprawiały się tam nabożeństwa po słowiańsku, grecku i łacinie, a wśród mieszkańców istniało przekonanie, że modrzewiowy kościół, który rozebrano na początku XX w.