Leon Wodziński zaprosił do Służewa znanego rzeźbiarza Wacława Bębnowskiego, który w służewskiej świątyni wykonał między innymi: nowy ołtarz główny z okazałą pietą, chrzcielnicę, ambonę, oprawę rzeźbiarską loży kolatorskiej. Dekorację malarską wnętrza wykonał krakowski malarz Leon Kowalski. Witraże do kościoła wykonał warszawski Zakład św. Łukasza prowadzony przez Marię Łubieńską.

W 1901 roku do kościoła sprowadzono kopię rzymskiego obrazu Matki Bożej Nieustającej Pomocy wykonaną przez Giovaniego Burharda.

W czasie II wojny światowej w kościele urządzono magazyn zboża.

Kolejne, doraźne, prace remontowe przeprowadzono w latach 60. i 90. XX wieku. Prace te zniekształciły wcześniejszą, jednorodną aranżację wnętrza pochodzącą z przełomu XIX i XX wieku. W 2011 roku rozpoczęły się kompleksowe prace konserwatorskie we wnętrzu świątyni prowadzone przez zespół konserwatorów z Torunia pod kierunkiem Grażyny Szczerbińskiej. Prace, mające na celu przywrócenie młodopolskiego wystroju trwały 13 lat.