W latach 2005–2009 stanowisko naczelnego redaktora zajmował Zbigniew Galus, a redaktorami byli Jolanta Bukowska (Uniwersytet Warszawski) i Krzysztof Wojciechowski (Instytut Chemii Organicznej PAN). W skład zespołu redakcyjnego wchodzili: Bogdan Baranowski (Warszawa), Edward Dutkiewicz (Poznań), Barbara Grzybowska-Świerkosz (Kraków), Henryk Kozłowski (Wrocław), Mieczysław Mąkosza (Politechnika Warszawska), Marian Mikołajczyk (Łódź), Lucjan Sobczyk (Wrocław), Jerzy Suwiński (Gliwice).
W roku 1993 utworzono międzynarodowy komitet doradczy, w którego skład weszli: Norbert M. Bikales (Międzynarodowa Unia Chemii Czystej i Stosowanej, Livingston, NJ), Jacek Klinowski, (University of Cambridge), Philip Kocienski (University of Leeds), Jean-Marie Lehn (Uniwersytet w Strasburgu), R. Parsons (University of Southampton), Sergio Trasatti (Università di Milano), Henk C. van der Plas (Wageningen University & Research).
W JChem publikowano artykuły ze wszystkich dziedzin czystej chemii – artykuły oryginalne i przeglądowe, komunikaty, recenzje książek. Czasopismo było indeksowane w BazTech, Science Citation Index Expanded i .