Jules Germain Cloquet (ur. 18 grudnia 1790 w Paryżu, zm. 23 lutego 1883 tamże) – francuski lekarz, anatom i chirurg, pionier chirurgii przepuklinowej i autor szczegółowych opisów anatomicznych.
Życiorys Jules Germain Cloquet pochodził z rodziny lekarskiej. Jego starszy brat Hippolyte Cloquet (1787-1840) był również lekarzem i anatomem, a bratanek Ernest Cloquet (1818-1855) został osobistym lekarzem szacha Persji Mohammad Szah Kadżar.
Początkowo pracował jako uczeń w warsztacie swojego ojca Jean Baptiste Antoine, który był rysownikiem i grawerem. Studiował początkowo nauki przyrodnicze w Rouen, ale w 1810 przybył do Paryża, by poświęcić się medycynie. Już w następnym roku został preparatorem anatomii w szkole medycznej, a w 1815 prosektorem na wydziale. W 1817 uzyskał stopień doktora medycyny z rozprawą o przepuklinach brzusznych, w której opisał około 300 przypadków. Tego samego roku otrzymał nagrodę Académie des sciences za traktat, który został opublikowany dopiero sześć lat później.