Egidijus Vaitkūnas (ur. 8 sierpnia 1988 w Wilnie) – litewski piłkarz grający na pozycji obrońcy.
Kariera klubowa Vaitkūnas jest wychowankiem Žalgirisie Wilno, z którego w 2009 roku trafił najpierw do klubu Banga Gorżdy, a następnie Tauras Taurogi. W 2010 roku wrócił do klubu z Wilna i stał się podstawowym graczem. Po udanym sezonie 2010, w którym wystąpił w 26 meczach i zdobył dwie bramki, zainteresowanie młodym litewskim piłkarzem zaczęły wykazywać kluby z innych lig europejskich − rosyjski Spartak Nalczyk i belgijski Royal Charleroi. Vaitkūnas pozostał jednak w ŻalgirisieVMFD „Žalgiris“ pratęsė kontraktą su E.Vaitkūnu. Zimą 2014 roku został zawodnikiem czeskiego klubu Bohemians 1905.
Reprezentacja Vaitkūnas występował w reprezentacji Litwy do lat 21, w której rozegrał 13 meczów. W seniorskiej reprezentacji zadebiutował w 29 maja 2012 roku w meczu z RosjąInformacje na stronie eu-football.info.