Do największych wyznań protestanckich należą: prezbiterianie, zielonoświątkowcy, adwentyści dnia siódmego, baptyści, wolne kościoły ewangeliczne i anglikanie.
Islam Ponieważ istnieje duża liczba muzułmanów w tym kraju, islam jest powszechnie praktykowany. Islam wyznawany jest przede wszystkim wzdłuż południowego brzegu jeziora Malawi. Islam został wprowadzony przez arabskich handlarzy niewolników, którzy podróżowali głównie drogą morską. Dotarli do Malawi na początku XIX wieku i przekształcili plemiona wzdłuż brzegu jeziora. Ludzie z plemienia Yao wzdłuż południowego brzegu jeziora są najmocniej związani z islamem. Meczety znajdują się w miejscowościach Balaka, Machinga i Mangochi. Wiele szkół w Malawi uczy języka arabskiego tak, że dzieci mogą czytać Koran. Spory między muzułmanami a chrześcijanami w Malawi są rzadkością.