Ojciec Lennona, z pochodzenia Irlandczyk, był stewardem na luksusowym statku liniowym, a matka była córką byłego marynarza i pracownika firmy ubezpieczeniowej Tug Salvage Company. Z powodu przynależności do różnych warstw społecznych oraz mało stabilnej pracy Alfreda ich związek wywoływał opór rodziny Stanleyów. Mieszkali przy Newcastle Road w podmiejskiej dzielnicy Liverpoolu, w pobliżu ulicy Penny Lane. Gdy John miał dwa lata, jego ojciec opuścił rodzinę i wyruszył w podróż po świecie. Matka w tym czasie wdawała się w niezobowiązujące romanse z innymi mężczyznami. Alfred, powróciwszy do Wielkiej Brytanii, pragnął zamieszkać z synem w Nowej Zelandii. Lennon pozostał z matką, a ojciec zniknął z jego życia, ponownie spotkali się dopiero w 1968, kiedy to Lennon odwiedził ojca, wówczas żonatego z młodszą o ok. 35 lat kobietą.