Okres okupacji hitlerowskiej (1939–1945) był dla gminy tragiczny. Represje dotknęły większość rodzin, a życie straciło 87 mieszkańców – na froncie, w egzekucjach i obozach. Największą ofiarę poniosła wieś Źródła, gdzie Niemcy rozstrzelali 20 osób.
Wyzwolenie Tłuchowa i upamiętnienie 21 stycznia 1945 roku Tłuchowo i cała gmina zostały wyzwolone przez Armię Czerwoną. Władza przeszła w ręce nowej administracji, wspieranej przez sowieckiego komisarza wojennego i ochotniczą milicję.
Dla upamiętnienia ofiar okupacji, dzięki staraniom członków ówczesnego ZBoWiD oraz mieszkańców gminy, w centralnym punkcie Tłuchowa wzniesiono pomnik. Na tablicach umieszczono nazwiska poległych i pomordowanych, by oddać hołd tym, którzy zginęli w latach 1939–1945.
Polska Ludowa Po II wojnie światowej pierwszym wójtem został Antoni Plec, a sekretarzem Stefan Nadolski. Urząd Gminy wrócił do swojej przedwojennej siedziby.
Lata 1946–1950: Wprowadzono reformę rolną – rozparcelowano 10 majątków ziemskich. Wójtem zostali kolejno: Apolinary Mąkowski (1946) i Walenty Frejlichowski (1948). W 1950 r. zlikwidowano stanowisko wójta, zastępując je Gromadzką Radą Narodową (GRN).