Ostatnią część sezonu w Azji rozpoczęła od udziału w tokijskim turnieju Toray Pan Pacific Open. W ćwierćfinale pokonała Garbiñe Muguruzę 7:6(1), 6:1, a w walce o finał po raz czwarty w sezonie ograła Caroline Wozniacki, tym razem 6:2, 6:4. W decydującym meczu turnieju przegrała z Agnieszką Radwańską 2:6, 2:6. W turnieju cyklu WTA Premier 5 w Wuhanie w II rundzie po przegraniu pierwszego seta 2:6 z Camilą Giorgi poddała mecz. Następny występ to zawody cyklu WTA Premier Mandatory w Pekinie, gdzie swój udział również zakończyła na II rundzie oddając mecz walkowerem Mirjanie Lučić-Baroni.

Sezon zakończyła na czternastym miejscu w rankingu singlowym WTA Tour.

Sezon 2016 Szwajcarka rozpoczęła sezon od udziału w australijskich zawodach w Brisbane, jednakże w drugiej rundzie musiała uznać wyższość kwalifikantki Samanthy Crawford 5:7, 5:7. W drugim sprawdzianie przed Australian Open w Sydney Bencic zaprezentowała się znacznie lepiej, gdyż doszła do półfinału. W ćwierćfinale pokonała Jekatierinę Makarowa 6:0, 2:6, 6:4, jednak w walce o finał w pojedynku z Mónicą Puig skreczowała po przegraniu pierwszego seta 0:6.