Ukształtowanie terenu mały|lewo|Szczyt Kobylicy Gmina Prudnik swoim obszarem obejmuje część pasma Gór Opawskich, wchodzących w skład Sudetów Wschodnich. W granicach administracyjnych gminy Prudnik znajdują się następujące wzniesienia: góry i szczyty: Długota, Kapliczna Góra, Kobylica, Kozia Góra, Kraska, Młyńska Góra, Okopowa, Zajęcza Kępa, Wróblik wzgórza: Czyżykowa Góra, Jakuszowa, Szubieniczna Góra, Trupina, Ziębina
Do 1975 w granicach gminy znajdowała się również najwyższa góra województwa opolskiego – Biskupia Kopa, a także szczyty: Srebrna Kopa, Zamkowa Góra, Szyndzielowa Kopa, Bukowa Góra, Olszak, Jodłowe Wzgórze, Krzyżówka.
Na terytorium gminy położone są także doliny: Dębnicka Dolina i Ziębia Dolina.
Stosunki wodne mały|lewo|Złoty Potok w Łące Prudnickiej Przez obszar gminy Prudnik przepływają następujące cieki wodne: rzeki: Biała, Prudnik, Ścinawa Niemodlińska, Trzebinka, Złoty Potok potoki: Graniczny Potok, Lubrzanka, Meszna, Moszczaniecki, Psiniec, Zamecki Potok struga: Potoczyna
Do 1975 w granicach gminy znajdował się Bystry Potok i zbiornik przeciwpowodziowy w Jarnołtówku.
Pokrycie terenu Na terytorium gminy Prudnik znajdują się następujące formy pokrycia terenu: lasy: Las Niemysłowicki, Las Prudnicki, Pakosz łąki: Łąka Prudnicka