Bezpośrednio po tym sukcesie, w wieku 36 lat, zdecydował się zakończyć piłkarską karierę.
Kariera reprezentacyjna W 1987 roku Ortega został powołany przez trenera Jesúsa del Muro do reprezentacji Meksyku U-17 na Młodzieżowe Mistrzostwa Świata w Kanadzie. Tam wystąpił we wszystkich trzech spotkaniach, z czego w dwóch od pierwszej minuty, ani razu nie wpisując się na listę strzelców, natomiast jego kadra zanotowała w nich zwycięstwo, remis i porażkę, kończąc swój udział w turnieju już w fazie grupowej.
Kariera trenerska Od razu po zakończeniu kariery piłkarskiej Ortega rozpoczął pracę w roli szkoleniowca, znajdując zatrudnienie na stanowisku asystenta trenera w Chivas de Guadalajara. W latach 2003–2009 współpracował na tym stanowisku kolejno z Hansem Westerhofem, Benjamínem Galindo, Xabierem Azkargortą, José Manuelem de la Torre, Efraínem Floresem, Omarem Arellano i Francisco Ramírezem. W tym czasie osiągnął z Chivas sukcesy takie jak mistrzostwo Meksyku (Clausura 2006), dwukrotnie półfinał Copa Libertadores (2005 i 2006), półfinał Copa Sudamericana (2008) czy mistrzostwo InterLigi (2009). Ponadto w sierpniu 2005 po odejściu Galindo tymczasowo poprowadził drużynę w dwóch ligowych spotkaniach.