Pierwotnie, w sierpniu 2016 przedstawiono 20 uczestników ligi, po czym na początku września ze składu został skreślony HK Zielenograd, a już w trakcie sezonu tj. na początku listopada 2016 z rozgrywek został wykluczony zespół Krylja Kubani z powodów organizacyjnych. Tym samym pierwsze w historii rozgrywki NMHL ukończyło 18 drużyn. W strukturze rozgrywek zespoły nadal podzielono na dwie konferencje, w zachodniej skupiono 12 drużyn (ukończyło 11), a w zachodniej 7 zespołów.
Drużyna Miasto Klub nadrzędny (KHL / WHL / inne ligi) Konferencja Zachód MHK Biełgorod Biełgorod HK Briańsk Briańsk Dizelist Penza Dizel Penza HK Dmitrow Dmitrow Draguny Możajsk Krylja Kubani Kubań Buran Woroneż MHK Lipieck Lipieck Kubań Krasnodar Łoko-Junior Jarosław Łokomotiw Jarosław Rossosz Rossosz Buran Woroneż Siewierskie Wołki Siewierskaja SKA-Karelija Kondopoga SKA Sankt Petersburg Twiericzi Twer THK Twer Konferencja Wschód Batyr Nieftiekamsk Toros Nieftiekamsk Gorniak Uczały Junior Kurgan Zauralje Kurgan Jużnyj Urał-Mietałłurg Orsk Jużnyj Urał Orsk Krasnojarskie Rysi Krasnojarsk Sokoł Krasnojarsk Mieczeł Czelabińsk